セーフティカーと赤旗

アクシデントによってレースの継続が困難になった場合、コース脇のオフィシャルポストで赤旗が提示され、レースは中断される。しかし、中断するまでではないと判断された場合は、セーフティカー（SC）が導入され、すべての車両は追い越し禁止となり、スピードを落とさなくてはならない。
SUPER GTでは、ピットレーンオープンが宣言されるまで、SC走行中のピットインは禁止。ガス欠症状が出たなど、止むを得ず入った場合は、60秒以上のペナルティストップが課せられる。また総周回の2/3を超えるタイミングと、SCランが重なってしまった場合はペナルティの対象とはならないものの、SC退出周には速やかにピットに入らなくてはならない。
SCラン中は5車身以内で整列しなくてはならず、開始から2周後をめどに車両はストレートに、GT500クラスとGT300クラスに分かれて停止。トップの車両より前にいる車両は、SCの指示により前に出て、1周して隊列の後方に並ぶこととなる。これは強制的に周回遅れとなってしまうのを、極力防ごうという配慮による。
その後、クラスごとSCランが再開され、終了を告げるのはSCのルーフ上にあるランプの消灯。その後はスタート手順同様、コントロールラインを超えるまで追い越しは禁止されるが、先頭の車両はいかなるタイミング加速を開始してもいいので、後続車両との駆け引きも見どころのひとつとなる。